ほとんどのクロマチックハーモニカ用の楽譜は12穴（3オクターヴ）で演奏することができます。16穴（4オクターヴ）の最低音部は出しづらいということもあり、あまり使われる頻度は高くありません。ジャズやポップですと好んで16穴の最低音部を使うことがありますが、お教室などで指定がないのであれば、12穴をおすすめしております。

12穴、14穴、16穴の違いを詳しく書いた記事がありますので、こちらをご参照ください。
クロマチックハーモニカ 12穴、14穴、16穴比較